More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0995 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  100 
 
 		 114 aa  229  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  85.09 
 
 		 114 aa  199  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  80.7 
 
 		 114 aa  195  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  77.19 
 
 		 114 aa  182  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1224  ribosomal protein L20  76.32 
 
 		 114 aa  179  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00301137  hitchhiker  0.00307166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  75.22 
 
 		 114 aa  176  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  74.56 
 
 		 115 aa  170  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_002950  PG0989  50S ribosomal protein L20  71.93 
 
 		 115 aa  169  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1909  ribosomal protein L20  71.05 
 
 		 114 aa  168  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0153  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.285094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  61.26 
 
 		 115 aa  137  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  59.65 
 
 		 118 aa  136  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2504  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 115 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1712  50S ribosomal protein L20  60.36 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0580662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  59.46 
 
 		 115 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  55.26 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 		 118 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2939  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0120  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0173  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0620  ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  63.73 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  63.73 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1191  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 120 aa  130  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  62.26 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2923  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  57.89 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  55.26 
 
 		 119 aa  126  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1932  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00425676  normal  0.0301455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>