More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0366 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  100 
 
 
117 aa  241  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
125 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  70.09 
 
 
121 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  70.09 
 
 
125 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  69.23 
 
 
121 aa  168  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 
133 aa  167  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 
119 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 
118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 
118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 
119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  66.96 
 
 
118 aa  160  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  64.96 
 
 
118 aa  160  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  66.09 
 
 
118 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 
118 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  65.22 
 
 
118 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 
125 aa  156  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 
119 aa  155  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  70.75 
 
 
125 aa  155  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  62.39 
 
 
117 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 
119 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 
119 aa  154  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 
120 aa  154  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 
134 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 
119 aa  154  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 
119 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  153  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  153  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
121 aa  153  9e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  153  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1910  50S ribosomal protein L20  71.84 
 
 
121 aa  153  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 
134 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 
119 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 
119 aa  151  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
117 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  61.54 
 
 
117 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  64.1 
 
 
119 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  61.34 
 
 
121 aa  150  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3092  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
119 aa  149  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.907981  normal  0.0375631 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0215  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
117 aa  149  8.999999999999999e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0625735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
134 aa  149  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
118 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
119 aa  148  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
117 aa  148  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
124 aa  147  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
134 aa  147  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  59.66 
 
 
121 aa  147  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
119 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  59.83 
 
 
119 aa  147  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2923  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  147  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
134 aa  147  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  59.83 
 
 
118 aa  147  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
121 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
124 aa  147  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
120 aa  147  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
133 aa  147  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
118 aa  147  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  58.97 
 
 
118 aa  146  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1885  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 
118 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0110106 
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
134 aa  146  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 
134 aa  146  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  59.83 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>