More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0989 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0989  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  76.32 
 
 		 114 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  75.44 
 
 		 114 aa  182  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1224  ribosomal protein L20  74.56 
 
 		 114 aa  177  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00301137  hitchhiker  0.00307166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  72.81 
 
 		 114 aa  176  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  71.93 
 
 		 114 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  70.8 
 
 		 114 aa  168  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1909  ribosomal protein L20  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  67.54 
 
 		 115 aa  156  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 114 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  61.82 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0153  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.285094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0120  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2504  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1712  50S ribosomal protein L20  57.27 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0580662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2939  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0173  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  52.63 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  54.55 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  54.72 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  51.75 
 
 		 117 aa  120  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1910  50S ribosomal protein L20  56.31 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 133 aa  119  9e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  55.66 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  54.72 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  52.83 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  51.82 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1932  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00425676  normal  0.0301455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1453  ribosomal protein L20  55.05 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0686  50S ribosomal protein L20  54.55 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.499897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  50.91 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  48.7 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  52.94 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  52.94 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  47.83 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>