More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0153 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0153  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 115 aa  229  9e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.285094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2504  50S ribosomal protein L20  93.04 
 
 		 115 aa  219  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0173  50S ribosomal protein L20  88.7 
 
 		 115 aa  209  9e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0120  50S ribosomal protein L20  86.09 
 
 		 115 aa  208  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1712  50S ribosomal protein L20  83.93 
 
 		 115 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0580662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  83.33 
 
 		 115 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  79.13 
 
 		 115 aa  193  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 114 aa  147  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 114 aa  141  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  57.66 
 
 		 117 aa  133  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 117 aa  133  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1453  ribosomal protein L20  58.72 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1909  ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_002950  PG0989  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0620  ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  57.27 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  51.79 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  51.35 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  58.49 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  56.88 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  56.88 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 118 aa  127  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  50.45 
 
 		 121 aa  127  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 		 118 aa  127  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  55.05 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  50.89 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 119 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  55.45 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  55.36 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2767  50S ribosomal protein L20  56.6 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2640  50S ribosomal protein L20  56.6 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  51.79 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  50 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  53.15 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  51.82 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  53.15 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  53.15 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  49.11 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  55.96 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  53.21 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  48.65 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  54.05 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  52.68 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>