More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0427 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  100 
 
 		 117 aa  229  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 117 aa  150  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 118 aa  150  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 117 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  64.15 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  64.15 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  60 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 115 aa  137  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  54.7 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 115 aa  133  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 117 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 117 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  58.62 
 
 		 117 aa  133  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  57.76 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  61.82 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 117 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  53.45 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2994  ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  58.72 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  129  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0715  50S ribosomal protein L20  58.72 
 
 		 121 aa  129  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  59.63 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>