More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0027 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 114 aa  229  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  85.96 
 
 		 114 aa  202  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  85.09 
 
 		 114 aa  199  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  76.32 
 
 		 114 aa  185  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1224  ribosomal protein L20  76.32 
 
 		 114 aa  184  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00301137  hitchhiker  0.00307166 
 
 
-
 
NC_002950  PG0989  50S ribosomal protein L20  75.44 
 
 		 115 aa  182  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  75.22 
 
 		 114 aa  179  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  71.93 
 
 		 115 aa  165  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1909  ribosomal protein L20  68.42 
 
 		 114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2939  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1191  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  57.02 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0153  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.285094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  57.27 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2504  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0686  50S ribosomal protein L20  58.18 
 
 		 120 aa  127  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.499897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1712  50S ribosomal protein L20  56.36 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0580662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  55.45 
 
 		 115 aa  127  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1932  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00425676  normal  0.0301455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  52.63 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0173  50S ribosomal protein L20  52.73 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0120  50S ribosomal protein L20  49.56 
 
 		 115 aa  123  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0215  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0625735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0620  ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  58.49 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  57.55 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 119 aa  121  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  57.84 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2923  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  120  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  50.88 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  52.25 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2674  50S ribosomal protein L20  60.58 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.36852 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  50.94 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>