More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1909 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1909  ribosomal protein L20  100 
 
 		 114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1224  ribosomal protein L20  75.44 
 
 		 114 aa  173  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00301137  hitchhiker  0.00307166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  73.45 
 
 		 114 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  71.05 
 
 		 114 aa  168  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  71.05 
 
 		 114 aa  164  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  69.3 
 
 		 114 aa  164  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  71.93 
 
 		 115 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  68.42 
 
 		 114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0989  50S ribosomal protein L20  68.42 
 
 		 115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 115 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0620  ribosomal protein L20  62.83 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0120  50S ribosomal protein L20  53.98 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0153  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.285094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1712  50S ribosomal protein L20  55.45 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0580662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0173  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2504  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  53.51 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  57.27 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  56.6 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  56.6 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  55.26 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  50 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  53.51 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  54.39 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  56.19 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  55.66 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  55.66 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  52.29 
 
 		 117 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  52.68 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  51.82 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  54.21 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  52.29 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  56.07 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  50 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 117 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>