More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf194 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
119 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 
118 aa  144  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
119 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 
118 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 
118 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 
118 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 
118 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 
118 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 
117 aa  141  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 
118 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  56.52 
 
 
121 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 
118 aa  140  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
139 aa  137  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  58.12 
 
 
196 aa  135  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
118 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 
118 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 
117 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 
119 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
119 aa  133  9e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  57.76 
 
 
118 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
119 aa  129  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  59.6 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  59.6 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  55.65 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0224  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
120 aa  128  3e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000372144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  53.39 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 
119 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  56.03 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2031  50S ribosomal protein L20P  60.2 
 
 
101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000296283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  124  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  50 
 
 
119 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1407  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.94552e-17  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
125 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
125 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
117 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  56.76 
 
 
117 aa  123  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  53.04 
 
 
119 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 
119 aa  122  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  49.14 
 
 
117 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 
119 aa  122  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
121 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  52.17 
 
 
117 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  121  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
119 aa  120  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
121 aa  120  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
117 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
121 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
121 aa  120  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1044  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
116 aa  120  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215802  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>