More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1235 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  100 
 
 		 117 aa  236  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  85.47 
 
 		 117 aa  201  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  83.76 
 
 		 117 aa  194  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 121 aa  150  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  60.68 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  59.65 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  58.12 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 125 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  143  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  143  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  58.97 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  58.97 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  58.97 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  58.12 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  58.97 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1685  50S ribosomal protein L20  68.09 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 117 aa  140  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 120 aa  139  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 121 aa  137  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2767  50S ribosomal protein L20  61.32 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2640  50S ribosomal protein L20  61.32 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>