More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1105 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  100 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  86.72 
 
 		 128 aa  225  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  86.72 
 
 		 128 aa  221  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  82.03 
 
 		 130 aa  215  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  87.5 
 
 		 128 aa  213  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  83.59 
 
 		 129 aa  213  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  86.29 
 
 		 126 aa  211  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  83.87 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  78.74 
 
 		 127 aa  206  7e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  80.65 
 
 		 157 aa  205  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  79.84 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  79.84 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  80.33 
 
 		 153 aa  199  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  88.6 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0477  ribosomal protein L20  81.1 
 
 		 127 aa  198  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  79.84 
 
 		 129 aa  196  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  79.84 
 
 		 129 aa  196  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  79.84 
 
 		 129 aa  196  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  76.61 
 
 		 129 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  81.36 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  79.03 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  76.61 
 
 		 126 aa  191  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  75.61 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  75.81 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  80.51 
 
 		 125 aa  187  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  73.39 
 
 		 127 aa  186  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 124 aa  183  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  78.57 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  75.21 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2064  50S ribosomal protein L20  72.66 
 
 		 125 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0330135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  76.27 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  75.63 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3540  50S ribosomal protein L20  79.03 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0376723  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  74.17 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  75.44 
 
 		 127 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2846  ribosomal protein L20  75 
 
 		 126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  77.68 
 
 		 126 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  64.96 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 117 aa  147  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  66.09 
 
 		 122 aa  147  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  65.81 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  62.18 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  58.82 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  53.85 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  55.37 
 
 		 125 aa  130  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  54.55 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 		 116 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 133 aa  126  9.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 117 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  53.78 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  53.78 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  52.1 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3092  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.907981  normal  0.0375631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  54.7 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  52.94 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  52.1 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1932  50S ribosomal protein L20  54.62 
 
 		 120 aa  120  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00425676  normal  0.0301455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  51.28 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>