More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05740 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  83.76 
 
 		 117 aa  204  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  83.76 
 
 		 117 aa  200  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  64.96 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  150  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  64.1 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  150  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  65.49 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1685  50S ribosomal protein L20  77.66 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  63.25 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  65.49 
 
 		 120 aa  148  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  147  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  65.49 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  64.1 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  65.49 
 
 		 122 aa  146  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  62.39 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  58.97 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  63.96 
 
 		 117 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  62.83 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  67.52 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  65.49 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2064  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0330135  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  57.26 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  60.68 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  66.37 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  65.09 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  137  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 119 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 121 aa  135  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>