More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1685 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1685  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  68.22 
 
 		 117 aa  153  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  74.77 
 
 		 117 aa  153  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1044  50S ribosomal protein L20  65.49 
 
 		 116 aa  152  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  66.96 
 
 		 117 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  64.22 
 
 		 117 aa  151  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  64.86 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 117 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  63.48 
 
 		 117 aa  147  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  63.96 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  63.06 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  63.96 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  58.77 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 119 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 119 aa  143  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2064  50S ribosomal protein L20  63.06 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0330135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  60 
 
 		 120 aa  140  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  58.77 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  60.71 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  59.46 
 
 		 129 aa  140  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 117 aa  139  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  58.88 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  62.04 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  60.71 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  60 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  63.39 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  58.93 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  60 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 117 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  69 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  68 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  58.04 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  58.04 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  58.72 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  58.26 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  56.78 
 
 		 196 aa  134  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  57.8 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>