More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1044 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1044  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  59.13 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  59.62 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  57.8 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  57.8 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  58.72 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  57.55 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  60.95 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 117 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  66 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  54.46 
 
 		 117 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  57.55 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  54.46 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  56.07 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  65 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  60.58 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  65 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  57.27 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  57.27 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  56.6 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  57.8 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  56.6 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  66.32 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  53.57 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  56.6 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  54.46 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  56.6 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  55.96 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  59.62 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  53.64 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  56.88 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>