More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2064 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2064  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0330135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  89.26 
 
 		 123 aa  220  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  78.29 
 
 		 129 aa  206  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  80.8 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  81.51 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  76.74 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  75.2 
 
 		 157 aa  193  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  78.81 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  76.86 
 
 		 153 aa  191  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  76.03 
 
 		 121 aa  191  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  77.31 
 
 		 128 aa  189  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  73.6 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  72.87 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  72.87 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  72.87 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  81.58 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  74.19 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  72.87 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  72.8 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  77.31 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  76.27 
 
 		 126 aa  186  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  78.57 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  72.66 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  73.95 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  70.54 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  68.8 
 
 		 125 aa  180  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  70.83 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  68.5 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  75.44 
 
 		 127 aa  177  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  71.2 
 
 		 130 aa  176  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  76.27 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  75.42 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  76 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  65.89 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0477  ribosomal protein L20  75.63 
 
 		 127 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3540  50S ribosomal protein L20  74.42 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0376723  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2846  ribosomal protein L20  69.6 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  58.97 
 
 		 117 aa  145  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  64.1 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  55.56 
 
 		 117 aa  141  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  56.3 
 
 		 120 aa  140  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  139  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  56.3 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1685  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  56 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  55.2 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  55.46 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  133  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  53.78 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  58.12 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  54.2 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 134 aa  130  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 134 aa  130  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  52.1 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  52.1 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  51.26 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  127  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  127  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 119 aa  127  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  52.03 
 
 		 196 aa  128  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3092  50S ribosomal protein L20  52.94 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.907981  normal  0.0375631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>