More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1278 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  73.33 
 
 
139 aa  188  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  67.83 
 
 
118 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  63.79 
 
 
119 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  62.93 
 
 
119 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  65.81 
 
 
117 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
118 aa  151  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  58.97 
 
 
121 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 
118 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 
118 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 
118 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1407  50S ribosomal protein L20  65.38 
 
 
118 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.94552e-17  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  68 
 
 
119 aa  142  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  68 
 
 
119 aa  141  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 
118 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  60.71 
 
 
117 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
118 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2031  50S ribosomal protein L20P  64.65 
 
 
101 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000296283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  57.76 
 
 
118 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  58.62 
 
 
117 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 
117 aa  131  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  56.9 
 
 
117 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  54.7 
 
 
120 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
120 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 
116 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  56.9 
 
 
119 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 
119 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  55.24 
 
 
133 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  55.36 
 
 
117 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  51.26 
 
 
121 aa  124  9e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
117 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2064  50S ribosomal protein L20  52.03 
 
 
125 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0330135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  48.67 
 
 
125 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 
117 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
117 aa  121  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 
118 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
119 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
119 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  53.78 
 
 
119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  53.57 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
120 aa  119  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  119  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
119 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 
124 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  55.36 
 
 
118 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
120 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  55.36 
 
 
118 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  51.28 
 
 
123 aa  118  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  50.41 
 
 
127 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
119 aa  118  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 
117 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
119 aa  117  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  55.36 
 
 
118 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  55.36 
 
 
118 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  55.36 
 
 
118 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  55.36 
 
 
118 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
118 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  55.36 
 
 
118 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
117 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  50.43 
 
 
119 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  53.1 
 
 
117 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
119 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  48.82 
 
 
129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
121 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  54.46 
 
 
119 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  54.46 
 
 
118 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  48.82 
 
 
129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
119 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
119 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  52.68 
 
 
118 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  48.82 
 
 
129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  48.82 
 
 
129 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
119 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1044  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
116 aa  115  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>