More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl190 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
120 aa  243  6e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  80.51 
 
 
119 aa  197  5e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  57.98 
 
 
121 aa  146  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 
119 aa  141  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  59.46 
 
 
119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  58.26 
 
 
117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  59.46 
 
 
119 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  133  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  53.33 
 
 
133 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0224  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000372144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  54.62 
 
 
119 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  54.62 
 
 
119 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 
119 aa  130  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2031  50S ribosomal protein L20P  67.33 
 
 
101 aa  130  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000296283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  64.71 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 
139 aa  127  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  55.86 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0348  ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000203448  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0492  ribosomal protein L20  56.76 
 
 
116 aa  123  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  50.43 
 
 
117 aa  122  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  52.5 
 
 
120 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  50.85 
 
 
118 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
118 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
118 aa  121  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  51.69 
 
 
124 aa  122  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  48.74 
 
 
119 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  50.43 
 
 
117 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  51.69 
 
 
118 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
121 aa  120  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1407  50S ribosomal protein L20  58.49 
 
 
118 aa  120  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.94552e-17  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  51.28 
 
 
117 aa  120  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0215  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0625735  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  48.72 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  48.74 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  52.25 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0715  50S ribosomal protein L20  53.21 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.884978  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  52.99 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  48.74 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  50.43 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  50.41 
 
 
121 aa  117  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1163  ribosomal protein L20  54.05 
 
 
114 aa  116  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000242027  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
119 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0113  50S ribosomal protein L20  55.88 
 
 
117 aa  116  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
134 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  50.43 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  49.17 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  46.55 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  48.74 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  49.58 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  45.38 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  47.9 
 
 
127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0223  50S ribosomal protein L20  46.22 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  48.67 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  49.15 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  47.9 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  48.72 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  47.9 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  46.67 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  49.54 
 
 
115 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
119 aa  114  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
134 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  48.76 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  49.15 
 
 
119 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  48.72 
 
 
117 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  49.15 
 
 
120 aa  114  5e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0188  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 
115 aa  114  5e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.608699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  47.01 
 
 
126 aa  114  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  48.33 
 
 
123 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>