More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0715 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0715  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  57.98 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  57.98 
 
 		 119 aa  143  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  57.98 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  58.62 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 117 aa  141  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  58.62 
 
 		 117 aa  141  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 117 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  55.46 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  54.31 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  133  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  53.72 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  54.39 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  53.78 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  52.59 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  52.89 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  53.78 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 		 119 aa  129  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  50.86 
 
 		 119 aa  127  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  55.66 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  55.66 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 		 133 aa  127  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  50.44 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2767  50S ribosomal protein L20  57.55 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2640  50S ribosomal protein L20  57.55 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  51.26 
 
 		 119 aa  127  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 115 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  56.6 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>