More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0430 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  74.58 
 
 
119 aa  175  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  66.67 
 
 
118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 
125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
121 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
121 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
125 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  66.95 
 
 
119 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 
117 aa  157  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
118 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 
117 aa  157  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 
118 aa  157  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
118 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
119 aa  156  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
119 aa  155  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
118 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 
118 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 
118 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 
119 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 
118 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 
118 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 
119 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 
118 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 
119 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
119 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
119 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  62.71 
 
 
118 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 
118 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 
118 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  64.41 
 
 
118 aa  153  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 
119 aa  153  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  66.09 
 
 
115 aa  153  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 
119 aa  153  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  64.1 
 
 
117 aa  152  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 
117 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
119 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 
118 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 
134 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  64.1 
 
 
117 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
119 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 
119 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  63.33 
 
 
121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 
134 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 
119 aa  150  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 
120 aa  150  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 
117 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 
119 aa  149  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 
134 aa  149  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  62.39 
 
 
118 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 
119 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 
119 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 
119 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
134 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 
119 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 
119 aa  147  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 
119 aa  148  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 
118 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  60.83 
 
 
121 aa  147  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1453  ribosomal protein L20  66.06 
 
 
119 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  61.34 
 
 
119 aa  147  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
120 aa  147  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  66.04 
 
 
125 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  57.63 
 
 
120 aa  147  6e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  57.63 
 
 
118 aa  146  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 
119 aa  146  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 
118 aa  146  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 
118 aa  146  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1910  50S ribosomal protein L20  67.96 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  57.63 
 
 
119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  62.71 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  58.82 
 
 
125 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2939  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
121 aa  145  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 
118 aa  144  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2767  50S ribosomal protein L20  64.15 
 
 
119 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2640  50S ribosomal protein L20  64.15 
 
 
119 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>