More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1342 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  100 
 
 
117 aa  233  7e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  68.14 
 
 
119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  68.14 
 
 
119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  67.26 
 
 
118 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  67.26 
 
 
117 aa  154  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  70.27 
 
 
117 aa  153  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  65.22 
 
 
119 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  64.6 
 
 
118 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  65.49 
 
 
118 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  64.6 
 
 
117 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  63.48 
 
 
119 aa  148  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  65.77 
 
 
119 aa  147  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 
121 aa  146  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  61.74 
 
 
121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  64.6 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  62.83 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  63.72 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  63.72 
 
 
118 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 
118 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 
118 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 
119 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  62.07 
 
 
118 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  62.07 
 
 
118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  61.95 
 
 
117 aa  142  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  62.07 
 
 
118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  62.07 
 
 
118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  62.07 
 
 
118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 
120 aa  141  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 
118 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  140  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  59.13 
 
 
118 aa  140  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
117 aa  140  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
119 aa  140  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
119 aa  140  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  140  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 
117 aa  140  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  60.53 
 
 
115 aa  139  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  62.83 
 
 
117 aa  139  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  60.36 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  62.83 
 
 
119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  61.95 
 
 
117 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
117 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  137  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
119 aa  137  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
119 aa  137  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
118 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
117 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  60 
 
 
119 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 
118 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  60 
 
 
119 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 
119 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 
119 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  57.39 
 
 
125 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 
119 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 
119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  59.29 
 
 
117 aa  134  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  66.67 
 
 
119 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  61.26 
 
 
117 aa  133  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  65.69 
 
 
119 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  53.98 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  56.64 
 
 
126 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  60 
 
 
119 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  60 
 
 
119 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  56.64 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  62.26 
 
 
117 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  57.02 
 
 
119 aa  131  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2606  50S ribosomal protein L20  67.54 
 
 
117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  59.29 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3500  50S ribosomal protein L20  67.54 
 
 
117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.193711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  57.26 
 
 
117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
119 aa  130  5e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  57.52 
 
 
129 aa  130  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  56.64 
 
 
129 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>