More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1441 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
139 aa  278  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  69.06 
 
 
196 aa  199  8e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 
117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  69.83 
 
 
119 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  68.7 
 
 
118 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  68.97 
 
 
119 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  67.86 
 
 
118 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  65.22 
 
 
118 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  65.22 
 
 
118 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  60.17 
 
 
121 aa  147  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  64.35 
 
 
118 aa  146  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  70 
 
 
119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1407  50S ribosomal protein L20  67.31 
 
 
118 aa  144  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.94552e-17  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 
117 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  69 
 
 
119 aa  143  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  62.61 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 
118 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2031  50S ribosomal protein L20P  67.68 
 
 
101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000296283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  57.39 
 
 
117 aa  136  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0981  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
117 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0960905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  59.29 
 
 
117 aa  134  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  58.97 
 
 
120 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  55.46 
 
 
121 aa  134  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  59.13 
 
 
117 aa  134  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
117 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  55.83 
 
 
124 aa  133  8e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
120 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 
118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 
118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
118 aa  130  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  55.83 
 
 
124 aa  130  5e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  61.11 
 
 
116 aa  130  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 
117 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
119 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  54.62 
 
 
121 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
119 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 
118 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  56.03 
 
 
118 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
119 aa  126  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  54.62 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 
133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2939  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  56.03 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 
118 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
117 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 
118 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 
118 aa  124  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  125  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  54.7 
 
 
119 aa  124  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 
118 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 
118 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  56.41 
 
 
119 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  52 
 
 
127 aa  124  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  123  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  123  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
125 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  53.85 
 
 
119 aa  124  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  54.24 
 
 
128 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>