More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0348 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0348  ribosomal protein L20  100 
 
 
118 aa  241  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000203448  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
119 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
121 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
121 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 
117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
121 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  53.91 
 
 
117 aa  123  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  51.3 
 
 
117 aa  123  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2154  50S ribosomal protein L20  52.29 
 
 
119 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000435469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  56.73 
 
 
125 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
119 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
125 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  50.43 
 
 
117 aa  120  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
119 aa  120  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  53.98 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  49.57 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0715  50S ribosomal protein L20  54.81 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.884978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  50.43 
 
 
129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  48.72 
 
 
119 aa  118  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
120 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  53.04 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  52.83 
 
 
119 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
119 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 
134 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
117 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
133 aa  116  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0711  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 
121 aa  116  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000004038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  49.14 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0925  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 
118 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00218095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  48.7 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1910  50S ribosomal protein L20  56.44 
 
 
121 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  52.17 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  50.89 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  52.17 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2923  50S ribosomal protein L20  49.11 
 
 
118 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 
119 aa  114  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  48.7 
 
 
119 aa  114  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
134 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  49.14 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
134 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  48.28 
 
 
118 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 
124 aa  114  6e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
120 aa  114  6e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  49.14 
 
 
118 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  49.14 
 
 
118 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  47.41 
 
 
117 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  48.28 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  50.93 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  46.96 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  48.28 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1044  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  48.7 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  47.41 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  47.41 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  50.47 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  47.37 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0536  ribosomal protein L20  52.68 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00112168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  46.09 
 
 
117 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  45.54 
 
 
163 aa  111  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  50 
 
 
117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  49.56 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  48.21 
 
 
129 aa  110  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  48.28 
 
 
119 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  47.83 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  47.83 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  47.83 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  47.83 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  47.83 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  47.83 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>