More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1303 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 133 aa  263  8.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  58.82 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  60.68 
 
 		 119 aa  139  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  53.33 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  54.62 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  52.85 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  54.7 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  57.02 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 133 aa  129  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  55.56 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  51.69 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  52.1 
 
 		 135 aa  126  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  51.59 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  51.69 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  55.05 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  55.83 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  55.05 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  57.8 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  55.24 
 
 		 196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2939  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  54.13 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  53.78 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  61.47 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  50.42 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  50.42 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  51.28 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  51.26 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 115 aa  121  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  53.27 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  50.41 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  57.84 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  52.1 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  53.21 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>