More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0215 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0215  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 117 aa  233  5.0000000000000005e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0625735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 124 aa  153  9e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3092  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.907981  normal  0.0375631 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 134 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  61.54 
 
 		 117 aa  149  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 125 aa  147  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2939  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.774249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2923  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1932  50S ribosomal protein L20  61.34 
 
 		 120 aa  141  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00425676  normal  0.0301455 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  54.7 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1191  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0044  50S ribosomal protein L20  63.21 
 
 		 119 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  57.98 
 
 		 121 aa  136  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 121 aa  135  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  62.26 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0448  50S ribosomal protein L20  63.21 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  56.41 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0165  50S ribosomal protein L20  63.21 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  56.41 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0039  50S ribosomal protein L20  61.32 
 
 		 119 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  55.46 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1453  ribosomal protein L20  58.72 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1910  50S ribosomal protein L20  62.14 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0686  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.499897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1885  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 120 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  54.7 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0430  ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0075  50S ribosomal protein L20  61.32 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  54.62 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>