More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1163 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1163  ribosomal protein L20  100 
 
 
114 aa  225  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000242027  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0492  ribosomal protein L20  82.46 
 
 
116 aa  189  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 
119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 
119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  57.89 
 
 
118 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  57.89 
 
 
117 aa  137  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  59.63 
 
 
118 aa  136  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 
118 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 
120 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 
117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  58.18 
 
 
117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 
119 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  59.82 
 
 
117 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 
118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  56.88 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  58.93 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
119 aa  129  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  58.93 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  57.66 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  60.71 
 
 
117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  58.56 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 
120 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  54.39 
 
 
118 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 
119 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0242  50S ribosomal protein L20  58.25 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 
119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 
118 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 
121 aa  127  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  53.64 
 
 
117 aa  126  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 
119 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 
119 aa  126  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  54.39 
 
 
117 aa  126  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 
119 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 
119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  58.93 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4638  50S ribosomal protein L20  61.82 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000337844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  52.63 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0207  50S ribosomal protein L20  62.11 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  57.02 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0113  50S ribosomal protein L20  58.82 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
119 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  56.76 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  56.76 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  53.15 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 
118 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3092  50S ribosomal protein L20  57.27 
 
 
119 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.907981  normal  0.0375631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 
117 aa  123  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0981  50S ribosomal protein L20  58.18 
 
 
117 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0960905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  57.66 
 
 
119 aa  123  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  53.1 
 
 
121 aa  122  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  50.88 
 
 
117 aa  122  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
119 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 
118 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 
119 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  57.14 
 
 
117 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 
119 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  54.39 
 
 
118 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  54.95 
 
 
119 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  54.05 
 
 
118 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>