More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0207 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0207  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 118 aa  237  4e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  76.92 
 
 		 117 aa  189  9e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  76.27 
 
 		 118 aa  189  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  75.21 
 
 		 117 aa  189  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0242  50S ribosomal protein L20  79.61 
 
 		 117 aa  176  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0113  50S ribosomal protein L20  76.07 
 
 		 117 aa  169  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0295  50S ribosomal protein L20  82.35 
 
 		 117 aa  156  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0270  50S ribosomal protein L20  82.35 
 
 		 117 aa  156  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0035  50S ribosomal protein L20  82.35 
 
 		 117 aa  156  8e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  58.97 
 
 		 117 aa  147  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  147  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1253  ribosomal protein L20  61.21 
 
 		 116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78638  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  143  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 117 aa  143  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1163  ribosomal protein L20  60.75 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000242027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  55.56 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 118 aa  140  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 117 aa  139  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  59.83 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  56.41 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 133 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>