More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4638 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4638  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000337844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 118 aa  156  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 118 aa  154  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 119 aa  150  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 120 aa  150  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3092  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.907981  normal  0.0375631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  64.41 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  62.93 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 119 aa  143  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1034  50S ribosomal protein L20  71.79 
 
 		 117 aa  143  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 117 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1436  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  62.39 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  57.63 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 119 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  140  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3161  50S ribosomal protein L20  71.79 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 119 aa  137  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 119 aa  136  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 133 aa  136  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  65.09 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1163  ribosomal protein L20  61.82 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000242027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>