More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1267 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 124 aa  245  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  77.17 
 
 		 129 aa  193  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  81.58 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  76.38 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  79.66 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  82.73 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  74.02 
 
 		 128 aa  188  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 127 aa  187  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 128 aa  186  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  79.66 
 
 		 121 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  78.81 
 
 		 126 aa  185  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  74.8 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  79.66 
 
 		 128 aa  184  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  77.24 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  77.97 
 
 		 125 aa  183  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  75.42 
 
 		 129 aa  182  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  77.97 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  78.23 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 		 127 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  80.51 
 
 		 130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2064  50S ribosomal protein L20  74.19 
 
 		 125 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0330135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  80.51 
 
 		 128 aa  179  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  75.42 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  83.64 
 
 		 126 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  75.42 
 
 		 125 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  75.44 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  74.58 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  74.58 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  74.58 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  73.73 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  73.68 
 
 		 127 aa  174  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0477  ribosomal protein L20  78.3 
 
 		 127 aa  174  5e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  74.58 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3540  50S ribosomal protein L20  79.41 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0376723  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2846  ribosomal protein L20  74.79 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  64.55 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  55.83 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  58.12 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  55.93 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  61.54 
 
 		 117 aa  133  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  52.99 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  52.85 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  51.26 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  53.23 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  53.23 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 118 aa  127  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  55.08 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  49.15 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  51.69 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  51.69 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  53.85 
 
 		 117 aa  123  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  50.85 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 117 aa  123  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  123  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  50.85 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  53.98 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>