More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4142 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  100 
 
 		 135 aa  268  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  73.44 
 
 		 130 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  77.31 
 
 		 125 aa  184  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  73.81 
 
 		 128 aa  183  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  73.81 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  70.31 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  71.54 
 
 		 123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  68.18 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  70.9 
 
 		 129 aa  180  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  72.22 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  77.68 
 
 		 126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  71.97 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  72.8 
 
 		 125 aa  180  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  73.95 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  73.95 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  73.81 
 
 		 126 aa  180  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  76.07 
 
 		 124 aa  180  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  75 
 
 		 121 aa  180  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  71.2 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  70.63 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  76.99 
 
 		 129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  75.63 
 
 		 128 aa  176  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  76.11 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  67.46 
 
 		 127 aa  173  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  79.46 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  69.84 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2064  50S ribosomal protein L20  69.6 
 
 		 125 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  68.75 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  68.75 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  68.75 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  71.97 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  67.97 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  70.09 
 
 		 127 aa  167  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0477  ribosomal protein L20  75.47 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  71.79 
 
 		 130 aa  163  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  65.62 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3540  50S ribosomal protein L20  75.49 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0376723  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2846  ribosomal protein L20  71.43 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  63.25 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  65.81 
 
 		 117 aa  141  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  60.5 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  56.41 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  52.5 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  54.55 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  52.1 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  51.69 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  51.69 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  53.45 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2355  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.030925  normal  0.100889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  58.82 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  58.82 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  53.98 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  54.55 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  50.42 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  50.42 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  52.73 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  52.5 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  52.73 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1685  50S ribosomal protein L20  57.73 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>