More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2154 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2154  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 119 aa  237  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000435469  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0348  ribosomal protein L20  52.29 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000203448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  56.19 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  48.57 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3754  ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129982 
 
 
-
 
NC_002620  TC0223  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0206  50S ribosomal protein L20  56.19 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1314  50S ribosomal protein L20  53.33 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1645  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194936  normal  0.0586413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  52.38 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  52.38 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  53.33 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2923  50S ribosomal protein L20  50.94 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  52.38 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3485  50S ribosomal protein L20  56.19 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  50.48 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  51.43 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  46.15 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  45.3 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  51.43 
 
 		 118 aa  110  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  49.52 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  52.34 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  47.62 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  47.86 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4534  50S ribosomal protein L20  53.33 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  46.67 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0188  50S ribosomal protein L20  48.18 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.608699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  53.33 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3092  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.907981  normal  0.0375631 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1044  50S ribosomal protein L20  50.98 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215802  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  48.54 
 
 		 117 aa  110  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  52.83 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  48.25 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2120  50S ribosomal protein L20  50.48 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.28003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  51.43 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2035  50S ribosomal protein L20  50.48 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  54.29 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  54.08 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  47.62 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0800  50S ribosomal protein L20  50.48 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  44.44 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  46.67 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  50.48 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  45.71 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  52.43 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  52.43 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  48.25 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1224  ribosomal protein L20  46.49 
 
 		 114 aa  106  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00301137  hitchhiker  0.00307166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  50.48 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  44.92 
 
 		 118 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  46.67 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  47.41 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  46.15 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2513  50S ribosomal protein L20  47.06 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0492  ribosomal protein L20  45.61 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1932  50S ribosomal protein L20  50.47 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00425676  normal  0.0301455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  44.92 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  45.71 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  50.94 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  45.1 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  47.62 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0231  50S ribosomal protein L20  47.06 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  44.12 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  45.71 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  43.81 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  46.22 
 
 		 119 aa  103  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  44.76 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  46.49 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  43.81 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  43.43 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  49.53 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  50.48 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  43.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  42.86 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  42.02 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  49.52 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  43.59 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  40.95 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1034  50S ribosomal protein L20  50.48 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  49.52 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0686  50S ribosomal protein L20  53.06 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.499897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  49.52 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3745  ribosomal protein L20  48.48 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.955368  normal  0.405047 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  47.17 
 
 		 196 aa  101  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  43.93 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  46.46 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4638  50S ribosomal protein L20  50.48 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000337844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  49.52 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  44.04 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  49.52 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  47.17 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>