More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2278 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2278  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 348 aa  713    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3367  transcriptional regulator, LacI family  29.6 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1461  transcriptional regulator, LacI family  28.32 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 		 347 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3000  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.69 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2505  LacI family transcription regulator  26.61 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2556  transcriptional regulator, LacI family  26.77 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000904675  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.77 
 
 		 368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27.48 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0763  regulatory protein, LacI  29.6 
 
 		 320 aa  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  29.68 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  26.99 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  28.37 
 
 		 333 aa  109  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0941  alanine racemase  29.74 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  26.91 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  27.01 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2808  LacI family transcription regulator  26.04 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0294888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6321  LacI family transcription regulator  28.03 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  27.14 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0150  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  25.41 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0300  LacI family transcription regulator  27.38 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2358  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2972  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.73 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2882  LacI family transcription regulator  27.79 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2992  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.9 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3019  LacI family transcription regulator  27.75 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  28.07 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  25.91 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  29.31 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.45 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.65 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  27.17 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  26.67 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.16 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  26.88 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2967  LacI family transcription regulator  27.17 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  29.68 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3388  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0528  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  25.15 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3062  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2031  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0336  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0349  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.912669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2253  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.22 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.99 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3708  transcriptional regulator, LacI family  27.73 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36497  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  27.06 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.78 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  26.63 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  25.29 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  24.85 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  25.22 
 
 		 358 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  30.83 
 
 		 340 aa  99.4  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  27.14 
 
 		 335 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  26.78 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  25.3 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  24.71 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4088  LacI family transcription regulator  24.92 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  24.64 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  27.51 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4264  alanine racemase  26.43 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.884026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  26.06 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.64 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  24.41 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  25.64 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  26.57 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  24.22 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  25.93 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.27 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  26.74 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3410  transcriptional regulator, LacI family  27.64 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.44 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  25.22 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  26.75 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  25.58 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  25.57 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0515  transcriptional regulator, LacI family  25.68 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  26.96 
 
 		 342 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1266  LacI family transcription regulator  28.33 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.33 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2737  LacI family transcription regulator  25.84 
 
 		 337 aa  96.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  26.01 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3372  transcriptional regulator, LacI family  23.99 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.125996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>