More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2882 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2882  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 339 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6321  LacI family transcription regulator  96.46 
 
 		 339 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2358  LacI family transcription regulator  97.35 
 
 		 339 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3019  LacI family transcription regulator  99.71 
 
 		 339 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2972  LacI family transcription regulator  97.35 
 
 		 339 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2992  LacI family transcription regulator  97.05 
 
 		 339 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2967  LacI family transcription regulator  97.05 
 
 		 339 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0150  LacI family transcription regulator  79.63 
 
 		 328 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0300  LacI family transcription regulator  81.73 
 
 		 339 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0425  transcriptional regulator, LacI family  79.57 
 
 		 328 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4284  LacI family transcription regulator  79.57 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3388  LacI family transcription regulator  81.13 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0528  LacI family transcription regulator  81.13 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3062  LacI family transcription regulator  81.13 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2031  LacI family transcription regulator  81.13 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0336  LacI family transcription regulator  81.13 
 
 		 339 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0349  LacI family transcription regulator  81.13 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.912669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2253  LacI family transcription regulator  81.13 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0454  LacI family transcription regulator  57.14 
 
 		 339 aa  345  5e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  54.37 
 
 		 330 aa  322  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  38.89 
 
 		 347 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.25 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.42 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.92 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  36.2 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  36.86 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  30.77 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.85 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  31.95 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  31.42 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.23 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.47 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  29.24 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.12 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.92 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  31.95 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  33.82 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  33.92 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 339 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  34.51 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.56 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  34.71 
 
 		 358 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.19 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  32.19 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  32.19 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2505  LacI family transcription regulator  28.2 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.91 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.91 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  36.73 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.91 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.61 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.91 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.91 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  33.72 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  34.9 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.13 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  33.53 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 352 aa  136  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  34.75 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  34.77 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  34.99 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  30.12 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.34 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.39 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0941  alanine racemase  30.38 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393533  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 341 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.44 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>