More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0912 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0912  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  100 
 
 
156 aa  306  8e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.050777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1092  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  69.48 
 
 
194 aa  213  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0132  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.76 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3852  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  28.29 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2327  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.17 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2323  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.52 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2499  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  31.17 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2502  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.52 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.852383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2243  RNA polymerase sigma-70 factor  31.17 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2824  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  31.17 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000658944 
 
 
-
 
NC_002936  DET0169  RNA polymerase sigma factor SigW, putative  30.77 
 
 
183 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3311  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.56 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.161259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2517  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  30.52 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0428935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2534  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.52 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00744607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2287  RNA polymerase sigma-70 factor  30.52 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000136578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2590  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  30.52 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00474772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1125  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.85 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233125  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2574  RNA polymerase, sigma-E factor; heat shock and oxidative stress  30.13 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1304  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.13 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4632  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1471  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.62 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133791  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26600  RNA polymerase sigma factor  25.64 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293886  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0953  RNA polymerase factor sigma C  30.77 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2258  RNA polymerase sigma factor  25 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1071  RNA polymerase factor sigma C  28.85 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2016  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.72 
 
 
225 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1791  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.68 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0942  RNA polymerase factor sigma C  30.07 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000303197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1202  RNA polymerase factor sigma C  29.37 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00251456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0766  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.11 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0964  RNA polymerase factor sigma C  29.37 
 
 
206 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000360939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3810  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.32 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0953  RNA polymerase factor sigma C  29.37 
 
 
177 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.3630899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1032  RNA polymerase factor sigma C  29.37 
 
 
177 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185519  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1348  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  26.28 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2068  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.32 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.903797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2758  RNA polymerase sigma factor  25.71 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000734686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1660  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.94 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392264 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2970  RNA polymerase sigma factor  25.71 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1342  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.16 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.524179  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1581  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.92 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0274  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.41 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.561325  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4230  RNA polymerase factor sigma C  30.07 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  hitchhiker  0.0000434661 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2966  RNA polymerase sigma factor  25.71 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000101714 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2200  RNA polymerase sigma factor SigX  29.75 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.262386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5692  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.75 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1131  RNA polymerase factor sigma C  28.67 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000936897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1861  RNA polymerase sigma factor SigW  31.17 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1658  RNA polymerase sigma factor SigW  31.17 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1636  RNA polymerase sigma factor SigW  31.17 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000576996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1838  RNA polymerase sigma factor SigW  31.17 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0433  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.95 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1789  RNA polymerase sigma factor SigW  31.17 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1110  RNA polymerase factor sigma C  28.67 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.8912e-18 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2649  RNA polymerase, sigma-E factor; heat shock and oxidative stress  25 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0544  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.32 
 
 
214 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355671 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1605  RNA polymerase sigma factor SigW  31.17 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2423  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  22.78 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0375  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.7 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3759  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.66 
 
 
180 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000323311  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3164  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.48 
 
 
168 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3071  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.22 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1027  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.38 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1130  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  24.68 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.938596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0740  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.03 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00362489  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4146  sigma-24 (FecI-like)  28.86 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03970  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.05 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0863  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.75 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  4.44823e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6883  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.06 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0420  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.03 
 
 
310 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11360  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  23.75 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4444  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.68 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0350  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.03 
 
 
311 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1159  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0940  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.76 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3194  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.03 
 
 
232 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8330  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.53 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00407021  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1660  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  29.68 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.379101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3540  RNA polymerase sigma factor SigW  30.52 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3845  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.52 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00095099  decreased coverage  0.00000359528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1912  RNA polymerase sigma factor SigW  30.52 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3098  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.45 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0184  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.32 
 
 
183 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0599  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  22.93 
 
 
190 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4021  sigma-24 (FecI-like)  25.58 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3433  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.8 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0229  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.92 
 
 
204 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0935  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.85 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000150168  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0859  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.97 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.632805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1890  transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 
199 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0184  RNA polymerase sigma factor  22.58 
 
 
203 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0696  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.2 
 
 
211 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000147428  decreased coverage  0.0000446652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3547  putative RNA polymerase sigma-e factor sigma-24  26.51 
 
 
205 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.257444  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2461  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.11 
 
 
202 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000164067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0200  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.18 
 
 
188 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594006  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3570  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.64 
 
 
221 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4243  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.87 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2088  RNA polymerase sigma factor SigX  26.45 
 
 
196 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.176045  normal  0.0352187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1025  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.1 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000320969  normal  0.488495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0095  sigma-24 (FecI-like)  27.67 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>