59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5373 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5373  type IV secretory pathway VirB3 family protein  100 
 
 		 88 aa  181  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0987094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5222  conjugal transfer protein  61.73 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1837  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  47.06 
 
 		 87 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1552  putative conjugal transfer trbD transmembrane protein  44.44 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0401164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4197  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  44.19 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3899  type IV secretory pathway, VirB3-like  43.02 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0728  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  41.67 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2647  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  43.53 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35700  P-type conjugative transfer protein TrbD  45 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3366  conjugal transfer protein trbD  45.35 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0964  putative conjugal transfer protein TrbD  44.19 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0436  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  43.21 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2006  putative conjugal transfer trbD transmembrane protein  43.21 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1284  putative conjugal transfer trbD transmembrane protein  40.48 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7743  conjugal transfer protein TrbD  44.44 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3704  conjugal transfer protein  43.21 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1343  putative conjugal transfer trbD transmembrane protein  43.75 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2909  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  41.18 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.809353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1897  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  43.75 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3504  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  43.75 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3998  conjugal transfer protein TrbB  47.37 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.865821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2352  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  43.21 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.438534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3002  conjugal transfer protein TrbB  45.24 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2349  type IV secretory pathway VirB3 family protein  48.05 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3088  conjugal transfer protein TrbB  43.75 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2582  conjugal transfer TrbD transmembrane protein  41.25 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1318  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  41.25 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2880  conjugal transfer protein TrbB  45.24 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0544772 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3196  conjugal transfer protein TrbB  47.44 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0747  conjugal transfer protein TrbB  42.53 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1502  conjugal transfer protein trbD  40 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3829  conjugal transfer protein TrbB  44.87 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0597  conjugal transfer protein TrbB  40.96 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3214  conjugal transfer protein TrbB  45 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0213609  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1482  conjugal transfer protein trbB  44.74 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1011  putative conjugal transfer protein; TrbD  41.86 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2697  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  42.5 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0609268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2029  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  45.68 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0154  conjugal transfer protein TrbB  43.59 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2270  conjugal transfer protein TrbD  41.98 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2826  type IV secretory pathway VirB3 family protein  39.53 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0507  conjugal transfer protein trbB  41.03 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7442  putative conjugal transfer protein trbD  42.11 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2322  conjugal transfer protein trbB  39.74 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0697  conjugal transfer protein TrbB  41.98 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3853  conjugal transfer protein  39.76 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0395049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3543  conjugal transfer protein trbB  40.24 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1192  conjugal transfer protein trbB  40.24 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0163  Type IV secretory pathway TrbD component-like protein  36.25 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.578435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3693  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  36.84 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2612  putative conjugal transfer protein  33.75 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3539  conjugal transfer protein TrbD  43.04 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00461066  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0316  conjugal transfer protein TrbD  35.44 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292303  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2348  type IV secretory pathway VirB3 family protein  34.57 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1718  type IV secretory pathway VirB3 family protein  35.06 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00082934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0806  conjugal transfer protein  40.96 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.529296  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6304  hypothetical protein  39.39 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1523  hypothetical protein  41.94 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6507  hypothetical protein  34.43 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>