218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0366 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0366  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
294 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.62 
 
 
297 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.19 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.96 
 
 
297 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
316 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  37.11 
 
 
619 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0729  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  26.71 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3092  NmrA-like protein  31.74 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08611  hypothetical protein  24.65 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0698127  hitchhiker  0.000145998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
298 aa  85.9  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13741  hypothetical protein  26.01 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.482957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14261  hypothetical protein  23.55 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0547193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.13 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 
506 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14021  hypothetical protein  24.12 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.066088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  25.29 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1479  hypothetical protein  30.57 
 
 
288 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.1879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  27.66 
 
 
320 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
330 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  29.05 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  25.12 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.39 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  26.62 
 
 
313 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
307 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
430 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0169  putative transmembrane oxidoreductase protein  26.36 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.28 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3788  putative transmembrane oxidoreductase protein  26.36 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754913  normal  0.999241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  25.49 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
450 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
306 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.92 
 
 
294 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.574819  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.49 
 
 
329 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 
319 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
327 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal  0.0846691 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  20.64 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.54 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1049  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.33 
 
 
412 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  23.31 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  28.8 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  25.27 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
323 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  28.32 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  31.1 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  27.04 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2944  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.84 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  28.8 
 
 
328 aa  49.7  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865539  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  25.87 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.23 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
381 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  35.56 
 
 
389 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0224  hypothetical protein  35.4 
 
 
322 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362913  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 
304 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.43 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 
335 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
321 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>