17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14021 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_14021  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  567  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.066088  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13741  hypothetical protein  41.24 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.482957  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0366  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08611  hypothetical protein  24.05 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0698127  hitchhiker  0.000145998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3788  putative transmembrane oxidoreductase protein  24.8 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754913  normal  0.999241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  20.54 
 
 		 619 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 440 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 440 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 440 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 		 435 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>