More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4794 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
310 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865539  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.84 
 
 
312 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1706  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  55.52 
 
 
309 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3788  putative transmembrane oxidoreductase protein  54.87 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754913  normal  0.999241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.84 
 
 
313 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0169  putative transmembrane oxidoreductase protein  54.22 
 
 
312 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.62 
 
 
312 aa  341  9e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.84 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.37 
 
 
190 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00840896  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0139  NAD dependent epimerase/dehydratase/dehydrogenase  39.29 
 
 
120 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.656323  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.3 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  23.75 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  21.89 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
512 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.074322  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.13 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  22.13 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  21.35 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  25 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  24.73 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  25 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.1 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  25.74 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17671  predicted protein  23.87 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.43 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0110  NADH dehydrogenase  26.21 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3092  NmrA-like protein  25.53 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  23.53 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  26.94 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.61 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  24.3 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
314 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  22.48 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.526116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 
286 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  22.74 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
327 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  23.99 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.86 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  21.86 
 
 
619 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.75 
 
 
450 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3296  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.35 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.587332  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  25.66 
 
 
340 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391729  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
439 aa  60.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4953  NADH dehydrogenase  23.89 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
317 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.64 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.94 
 
 
327 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
326 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.19 
 
 
323 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  22.73 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0729  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  22.69 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  24.29 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  24.6 
 
 
432 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0624037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  25.1 
 
 
432 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  23.74 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.47 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14261  hypothetical protein  22.98 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0547193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1479  hypothetical protein  26.05 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.1879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  21.78 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  30.07 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.5 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.88 
 
 
304 aa  56.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.74 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
342 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.69 
 
 
329 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.01 
 
 
345 aa  55.8  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>