16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0139 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0139  NAD dependent epimerase/dehydratase/dehydrogenase  100 
 
 		 120 aa  249  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.656323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0169  putative transmembrane oxidoreductase protein  50.44 
 
 		 312 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.410172  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 313 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3788  putative transmembrane oxidoreductase protein  46.9 
 
 		 312 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754913  normal  0.999241 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.32 
 
 		 312 aa  104  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.13 
 
 		 312 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1706  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.25 
 
 		 309 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.1 
 
 		 324 aa  90.9  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 		 310 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865539  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 		 302 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  27.38 
 
 		 302 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 308 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3092  NmrA-like protein  20 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 		 321 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>