More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0709 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  98.85 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  51.74 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  49.62 
 
 		 265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  47.67 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  43.61 
 
 		 287 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  45.77 
 
 		 279 aa  224  8e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  40.38 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  37.5 
 
 		 283 aa  211  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.25 
 
 		 282 aa  205  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.04 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.45 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.08 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.08 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  34.03 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  35.74 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  35.58 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  35.58 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  35.58 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  35.58 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  35.58 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  35.58 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  35.21 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  35.58 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  34.83 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  33.71 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  33.71 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  33.71 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  33.71 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  33.71 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  31.97 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  34.6 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  33.58 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  33.58 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  33.58 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  33.58 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  33.58 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  33.58 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  33.58 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  34.81 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  34.81 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  32.96 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  33.58 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  31.32 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  30.34 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  33.58 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  32.41 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  33.21 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  32.22 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  31.18 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  31.18 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  31.18 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  30.8 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  30.8 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  29.32 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  30.57 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  30.48 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  27.04 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  29.88 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  29.82 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  33.09 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  29.3 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  29.6 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  31 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  30.22 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  28.57 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  30.48 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  30.04 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  28.12 
 
 		 278 aa  92  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  30.12 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  30.29 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  29.14 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  28.04 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  28.09 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  30 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  27.17 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  29.1 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  29.56 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  29.56 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  29.1 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  28.88 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  29.56 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  26.87 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  29.32 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  28.67 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  26.91 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  29.56 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>