More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2820 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  100 
 
 
271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  100 
 
 
271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  99.26 
 
 
271 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  98.89 
 
 
271 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  98.89 
 
 
271 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  98.52 
 
 
271 aa  554  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  98.89 
 
 
271 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  95.93 
 
 
271 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  89.22 
 
 
269 aa  503  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  88.85 
 
 
269 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  88.85 
 
 
269 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  88.85 
 
 
269 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  88.48 
 
 
269 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  80.07 
 
 
271 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  91.38 
 
 
176 aa  329  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  52.22 
 
 
270 aa  295  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  53.33 
 
 
271 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  53.33 
 
 
271 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  53.33 
 
 
271 aa  292  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  53.33 
 
 
271 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  53.33 
 
 
271 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  52.22 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  51.85 
 
 
271 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  51.85 
 
 
271 aa  287  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  51.48 
 
 
271 aa  285  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  51.48 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  51.48 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  51.48 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  51.85 
 
 
271 aa  279  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  51.85 
 
 
271 aa  279  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  45.17 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  40.08 
 
 
269 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  41.47 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  36.64 
 
 
266 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  36.64 
 
 
266 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  35.09 
 
 
269 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  37.3 
 
 
265 aa  158  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  35.58 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  33.57 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  35.19 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  35.21 
 
 
262 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  32.56 
 
 
267 aa  141  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  32.83 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  30.74 
 
 
270 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  32.7 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  31.66 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  30.88 
 
 
279 aa  123  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  31.46 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  29.55 
 
 
265 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  30.6 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  30.96 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  31.48 
 
 
274 aa  109  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.52 
 
 
269 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  29.96 
 
 
264 aa  106  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  27.72 
 
 
268 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.71 
 
 
263 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.84 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25 
 
 
270 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.56 
 
 
281 aa  95.5  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  26.18 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  26.59 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  27.65 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25.66 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  28.3 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf524  COF family HAD hydrolase protein  28.26 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.61 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  26.42 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.85 
 
 
262 aa  82  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  26.71 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3962  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  26.13 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4271  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.596112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.55 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.69 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00157591  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4072  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.55 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0578925 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  26.13 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3881  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0852167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3808  HAD superfamily hydrolase  26.18 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0549007  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  25.47 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  26.92 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  26.18 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.24 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  27.97 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  27.18 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.21 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  28.14 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  25.86 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.19 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>