More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3309 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 
281 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  52.75 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.94 
 
 
282 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  46.86 
 
 
287 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  40.22 
 
 
265 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  37.04 
 
 
265 aa  188  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  37.04 
 
 
262 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  36.67 
 
 
262 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  40.52 
 
 
279 aa  180  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  37.41 
 
 
267 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  33.58 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  33.09 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 
256 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  32.5 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.37 
 
 
269 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.8 
 
 
270 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  30.51 
 
 
263 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 
265 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  29.24 
 
 
273 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.41 
 
 
263 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  27.96 
 
 
269 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 
264 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  30.77 
 
 
270 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  32.12 
 
 
271 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  32.12 
 
 
271 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  32.12 
 
 
271 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  29.78 
 
 
265 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  32.12 
 
 
271 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  31.75 
 
 
271 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  31.75 
 
 
271 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  31.75 
 
 
271 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  26.92 
 
 
268 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  30.69 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  30.69 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  31.6 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  30.69 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  29.93 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  31.6 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  29.56 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  29.56 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  29.56 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  29.56 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  29.2 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  29.56 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  32.12 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  28.42 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  29.56 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  32.12 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  31.23 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  31.23 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  31.23 
 
 
270 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  31.23 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  28.07 
 
 
271 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  31.23 
 
 
270 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  31.23 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  31.23 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  31.75 
 
 
271 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  29.93 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  25.54 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  29.56 
 
 
271 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  28.21 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  32.12 
 
 
271 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  29.93 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  26.81 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  29.93 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  32.12 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  32.12 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  26.81 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  29.93 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  30.86 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  31.39 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  29.56 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  27.55 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  29.29 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  27.54 
 
 
272 aa  87  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.55 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  24.1 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  26.43 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  25.42 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.26 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  25.63 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  25.69 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  27.24 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  25.27 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  25.7 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  23.89 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.14 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  25.95 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  24.73 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  23.89 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  29.23 
 
 
277 aa  79  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  24.82 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  26.16 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf524  COF family HAD hydrolase protein  23.74 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.96 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  28.11 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  28 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>