More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1724 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  39.53 
 
 
263 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  39.83 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  38.2 
 
 
271 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  37.3 
 
 
271 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  37.3 
 
 
271 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  37.3 
 
 
271 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  36.65 
 
 
271 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  35.09 
 
 
269 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  36.93 
 
 
271 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  36.89 
 
 
271 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  36.89 
 
 
271 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  36.89 
 
 
271 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  36.89 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  37.34 
 
 
269 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  37.34 
 
 
269 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  37.34 
 
 
269 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  37.34 
 
 
269 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  37.34 
 
 
269 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  37.88 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  37.88 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  37.88 
 
 
271 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  37.88 
 
 
271 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  37.88 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  37.5 
 
 
271 aa  152  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  37.5 
 
 
271 aa  152  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  38.52 
 
 
262 aa  152  8e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  37.07 
 
 
271 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  37.5 
 
 
271 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  37.07 
 
 
271 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  37.5 
 
 
271 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  39.66 
 
 
271 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  37.07 
 
 
271 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  39.22 
 
 
271 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  33.59 
 
 
265 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  34.16 
 
 
266 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  34.16 
 
 
266 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  33.05 
 
 
269 aa  127  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
270 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 
264 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  31.32 
 
 
279 aa  122  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  31.15 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  31.32 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  30.71 
 
 
272 aa  113  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  28.79 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  30.57 
 
 
262 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  30.53 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  30.42 
 
 
265 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.82 
 
 
281 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.35 
 
 
282 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  30.19 
 
 
287 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.33 
 
 
263 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  28.2 
 
 
268 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  32.51 
 
 
274 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 
265 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  27.01 
 
 
278 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  30.22 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  27.86 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  27.41 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  26.5 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  27.04 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  28.63 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  28.74 
 
 
256 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.34 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  35.92 
 
 
176 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.99 
 
 
269 aa  85.9  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  28.09 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  24.29 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf524  COF family HAD hydrolase protein  25.27 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  27.61 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  25.1 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.97 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.81 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.52 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  26.52 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  26.52 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  26.47 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.44 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  27.34 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  27.34 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  27.68 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  27.68 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  27.68 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  27.68 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  27.12 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  27.12 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  27.68 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  27.68 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  26.25 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  26.57 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  26.01 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  26.57 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  26.57 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  25.66 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  27.64 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>