More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1000 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  100 
 
 
271 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  99.63 
 
 
271 aa  557  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  99.26 
 
 
271 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  99.26 
 
 
271 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  98.89 
 
 
271 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  84.07 
 
 
271 aa  477  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  84.07 
 
 
271 aa  477  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  84.44 
 
 
271 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  83.7 
 
 
271 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  83.7 
 
 
271 aa  474  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  83.7 
 
 
271 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  83.7 
 
 
271 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  84.07 
 
 
271 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  83.7 
 
 
271 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  70 
 
 
270 aa  410  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  53.33 
 
 
271 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  53.33 
 
 
271 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  53.33 
 
 
271 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  53.14 
 
 
271 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  53.33 
 
 
271 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  53.33 
 
 
271 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  53.33 
 
 
271 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  53.33 
 
 
271 aa  299  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  52.96 
 
 
271 aa  298  8e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  50 
 
 
271 aa  287  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  49.81 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  49.44 
 
 
269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  49.44 
 
 
269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  49.44 
 
 
269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  49.44 
 
 
269 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  48.29 
 
 
263 aa  269  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  40.84 
 
 
269 aa  209  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  37.98 
 
 
262 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  36.33 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  36.33 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  36.09 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  43.75 
 
 
176 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  35.74 
 
 
265 aa  155  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  35.85 
 
 
269 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  32.83 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  30.74 
 
 
273 aa  136  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  30.22 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  28.2 
 
 
270 aa  125  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  34.32 
 
 
287 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  31.52 
 
 
267 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  31.03 
 
 
265 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
262 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
262 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  31.34 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.3 
 
 
263 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  30.55 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  29.96 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  31.11 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  30.19 
 
 
264 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  29.33 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  28.88 
 
 
269 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.45 
 
 
269 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.52 
 
 
282 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29 
 
 
270 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  27.24 
 
 
278 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  31.2 
 
 
283 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  29.18 
 
 
256 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.12 
 
 
281 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  26.15 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  29.28 
 
 
265 aa  92  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.97 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  26.45 
 
 
460 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  28.04 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  27.68 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  24.03 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1562  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104668  normal  0.0533762 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  23.23 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  27.24 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  25.28 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  25.93 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.29 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.15 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.24 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  24.56 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  25.93 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  25.74 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  25.74 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  22.89 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.44 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  25.45 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  21.88 
 
 
277 aa  72  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  24.25 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  25.37 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  25.99 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  24.65 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  24.05 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  25.36 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.05 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>