More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1377 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  35.71 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  31.09 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  30.94 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  32.83 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  30.57 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  30.57 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  32.83 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  32.83 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  30.57 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  32.83 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  30.57 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  30.57 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  33.96 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  33.96 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  30.57 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  32.83 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  32.83 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  32.83 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  32.45 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  32.08 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  32.45 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  30.57 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  30.57 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  30.07 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  32.2 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  32.2 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  32.2 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  32.2 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  32.2 
 
 		 269 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  31.7 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  31.18 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  30.74 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  28.2 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  28.2 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  28.2 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  30.57 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  28.2 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  28.2 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  31.2 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  28.41 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  29.28 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  26.98 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  28.79 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  29.23 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  29.71 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  29.23 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  30.32 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  28.63 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  27.61 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.54 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  26.3 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  28.24 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  25.51 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2070  HAD superfamily hydrolase  27.34 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208936  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  30.77 
 
 		 176 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  31.21 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1559  HAD superfamily hydrolase  26.87 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.847302  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  25.82 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.28 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  28.36 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  25.87 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  25.74 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  27.41 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  26.12 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  27.37 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  25.37 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.41 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  25.82 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  23.55 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  23.79 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  24.56 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  25.72 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  25.27 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.26 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  23.86 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.74 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  24.65 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  25.54 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  26.3 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  26.67 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  24.07 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  23.73 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  23.84 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  23.42 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  26.52 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  24.65 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.47 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>