More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0777 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
272 aa  568  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  40.53 
 
 
269 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  40.53 
 
 
269 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  40.53 
 
 
269 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  39.39 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  39.39 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  39.02 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  38.64 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  39.02 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  39.02 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  39.02 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  42.05 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  39.02 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  39.02 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  39.02 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  39.02 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  40.22 
 
 
273 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  39.02 
 
 
266 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  39.55 
 
 
273 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  39.55 
 
 
273 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  39.55 
 
 
273 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  39.55 
 
 
273 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  39.55 
 
 
273 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  38.64 
 
 
266 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  39.55 
 
 
273 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  39.55 
 
 
280 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  38.77 
 
 
274 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  38.77 
 
 
274 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  38.77 
 
 
274 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  39.93 
 
 
277 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  39.93 
 
 
291 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  39.18 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  37.93 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  39.55 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  40.61 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  38.81 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  38.04 
 
 
273 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  38.31 
 
 
274 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  38.06 
 
 
274 aa  194  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  37.93 
 
 
266 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  37.55 
 
 
270 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  35.36 
 
 
266 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  38.4 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  32.57 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  34.23 
 
 
273 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  33.85 
 
 
273 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  33.85 
 
 
273 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  32.18 
 
 
274 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  32.43 
 
 
272 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  32.05 
 
 
272 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  32.05 
 
 
272 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  32.05 
 
 
272 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  32.05 
 
 
272 aa  153  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  32.05 
 
 
272 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  32.05 
 
 
272 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  32.05 
 
 
272 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  32.43 
 
 
272 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  32.43 
 
 
272 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  33.08 
 
 
265 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  32.05 
 
 
272 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  32.05 
 
 
272 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  34.85 
 
 
263 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  32.05 
 
 
272 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  30.5 
 
 
272 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  31.09 
 
 
255 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.75 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 
269 aa  125  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.25 
 
 
279 aa  118  9e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  28.9 
 
 
267 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  31.3 
 
 
268 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 
262 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  27.24 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  26.3 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 
275 aa  92  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.44 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  26.53 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  29.3 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.74 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.22 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  30.29 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  27.48 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.11 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  24.69 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  29.46 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  27.56 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  26.16 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  25.2 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  25.2 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1759  HAD family hydrolase  27.56 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  25.19 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  23.58 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  27.51 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  27.57 
 
 
266 aa  79  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  25.71 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  27.35 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>