More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3826 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  96.34 
 
 		 273 aa  540  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  78.75 
 
 		 273 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  79.18 
 
 		 273 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  78.02 
 
 		 274 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  76.92 
 
 		 274 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  76.92 
 
 		 274 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  77.12 
 
 		 277 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  77.12 
 
 		 291 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  76.92 
 
 		 274 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  76.01 
 
 		 273 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  76.01 
 
 		 273 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  76.38 
 
 		 291 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  76.38 
 
 		 273 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  76.01 
 
 		 273 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  76.01 
 
 		 273 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  76.01 
 
 		 280 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  76.01 
 
 		 273 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  42.26 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  40.75 
 
 		 275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  39.55 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  38.4 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  37.45 
 
 		 265 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  38.83 
 
 		 266 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  39.33 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  39.92 
 
 		 263 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  39.03 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  37.59 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  37.59 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  37.59 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  37.59 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  38.66 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  38.66 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  37.59 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  36.88 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  37.22 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  37.22 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  37.22 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  37.22 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  37.22 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  38.06 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  38.06 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  38.95 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  35.36 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  34.96 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  33.72 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  33.72 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  33.72 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  33.72 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  33.72 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  33.72 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  33.72 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  33.33 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  35.71 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  34.59 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  34.59 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  34.1 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  34.48 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  34.48 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  34.48 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  34.1 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  34.1 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  32.92 
 
 		 255 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  31.32 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  32.59 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  29 
 
 		 269 aa  126  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.77 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  29 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  31.34 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.05 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  27.07 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  26.62 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  25.62 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.97 
 
 		 293 aa  99  7e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  27.35 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4036  Cof protein  28.25 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  33.09 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  27.35 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  28.98 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  28.33 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  30.91 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  32.27 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  30.63 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  30.26 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.98 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  32.12 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.1 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  32.12 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  28.47 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  28.79 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.63 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.67 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  30.66 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.87 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>