More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0516 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  100 
 
 		 272 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  98.9 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  98.9 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  98.53 
 
 		 272 aa  553  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  98.53 
 
 		 272 aa  553  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  80.88 
 
 		 272 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  80.88 
 
 		 272 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  80.88 
 
 		 272 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  80.88 
 
 		 272 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  80.88 
 
 		 272 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  80.88 
 
 		 272 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  80.51 
 
 		 272 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  81.25 
 
 		 272 aa  464  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  80.51 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  79.6 
 
 		 255 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  57.14 
 
 		 274 aa  329  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  55.51 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  55.51 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  55.51 
 
 		 273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  35.96 
 
 		 265 aa  181  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  39.31 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  39.31 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  39.31 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  36.5 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  38.02 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  37.31 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  37.31 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  37.31 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  37.31 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  37.31 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  37.31 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  37.31 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  37.31 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  37.31 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  36.23 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  36.36 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  36.23 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  34.72 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  33.08 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  35.77 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  35.47 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  36.78 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  35.47 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  35.47 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  35.47 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  36.26 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  35.88 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  38.78 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  35.09 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  34.1 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  35.98 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  32.95 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  31.3 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  32.43 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  28.96 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  30.48 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  31.12 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.87 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  26.17 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  29.34 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.71 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  31.28 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.52 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.63 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  26.25 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  30.64 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.32 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.49 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  25.21 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  26.97 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  31.51 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  26.75 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  23.7 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  26.75 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.75 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  27.13 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  27.23 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  27.87 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  23.16 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.7 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  29.58 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  27.92 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2751  Cof-like hydrolase  24.68 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.181052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  28.33 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  29.11 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  26.02 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  26.19 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>