More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1225 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
266 aa  546  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5042  Cof-like hydrolase  68.42 
 
 
267 aa  340  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.555444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  47.94 
 
 
273 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  48.31 
 
 
273 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  47.57 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  47.57 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  47.57 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  47.57 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  47.57 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  47.57 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  47.19 
 
 
273 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  46.82 
 
 
273 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  47.19 
 
 
273 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  39.1 
 
 
266 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  38.87 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  36.47 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  37.27 
 
 
270 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  33.71 
 
 
267 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  33.71 
 
 
267 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  36.8 
 
 
269 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  37.55 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  37.31 
 
 
275 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  34.34 
 
 
269 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1728  Cof-like hydrolase  38.02 
 
 
268 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  35.56 
 
 
279 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  34.2 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  34.2 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  34.2 
 
 
281 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  34.46 
 
 
273 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30.11 
 
 
271 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  33.83 
 
 
270 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  33.83 
 
 
270 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  33.83 
 
 
270 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  33.83 
 
 
270 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  33.83 
 
 
270 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  33.83 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  32.71 
 
 
268 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  33.83 
 
 
270 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  33.46 
 
 
270 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  33.83 
 
 
270 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  34.86 
 
 
279 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  33.46 
 
 
270 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  35.06 
 
 
268 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  31.85 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  31.48 
 
 
269 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  31.48 
 
 
269 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  31.73 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  33.83 
 
 
270 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  31.6 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  30.37 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  31 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  31.39 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  29.85 
 
 
277 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  31.11 
 
 
269 aa  131  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  30.63 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  28.74 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  30.6 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  31.54 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  30.26 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  29.89 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  33.22 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  32.58 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_002950  PG1653  hypothetical protein  29.85 
 
 
407 aa  126  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  29.64 
 
 
280 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  30.66 
 
 
268 aa  123  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  30.11 
 
 
271 aa  122  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.91 
 
 
272 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  30.07 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  32.71 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 
273 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  29.29 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  30.48 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  29.86 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 
270 aa  115  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.25 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  27.34 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  28.68 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.47 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0231  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 
268 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 
267 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  27.14 
 
 
265 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  28.15 
 
 
269 aa  105  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  27.55 
 
 
272 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  29.67 
 
 
269 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 
273 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  28.99 
 
 
269 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.01 
 
 
273 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  26.2 
 
 
267 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  26.2 
 
 
267 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  27.92 
 
 
274 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  25.93 
 
 
274 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  29.01 
 
 
257 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.35 
 
 
269 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  27.92 
 
 
273 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  29.35 
 
 
269 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.35 
 
 
269 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>