More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1519 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  100 
 
 		 277 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  94.95 
 
 		 277 aa  530  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  44.33 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  44.33 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  40.57 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  40.89 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  40.55 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  38.77 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  36.88 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  37.63 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  38.71 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  39.07 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  36 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  36.07 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  33.92 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  35.79 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  32.37 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  34.62 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  132  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  29.68 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  33.9 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  33.9 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  29.51 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  35.79 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  33.81 
 
 		 268 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  33.9 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  32.98 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  30.82 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  31.38 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  29.24 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.07 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  33.56 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.38 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  32.07 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  33.56 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.87 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  28.82 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  29.62 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.38 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  30.69 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0253  HAD superfamily hydrolase  31.03 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  27.01 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  30.22 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  27.01 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  30.53 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  31.03 
 
 		 281 aa  122  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  32.53 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.23 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  27.01 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.87 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  30.07 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.23 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1509  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  32.53 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  33.21 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  30.69 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  32.53 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  32.53 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  29.08 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  32.53 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  32.53 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  30.36 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  32.53 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  32.99 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  32.53 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  32.86 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  27.87 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  26.16 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.03 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  25.74 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  31.5 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  27.01 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  32.5 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  30.63 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  33.45 
 
 		 273 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  29.68 
 
 		 270 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.74 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  30.31 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  30.14 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  32.1 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  29.14 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  30.88 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  30.66 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  26.28 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  32.31 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  31.56 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  26.24 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.71 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  30.34 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  29.75 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  32.28 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  29.82 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>