More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3771 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  100 
 
 
273 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  66.03 
 
 
267 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  63.36 
 
 
267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  63.74 
 
 
267 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  64.5 
 
 
266 aa  298  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  63.74 
 
 
271 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  51.72 
 
 
270 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  49.81 
 
 
267 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  49.81 
 
 
270 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  46.44 
 
 
282 aa  241  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  48.28 
 
 
272 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  47.51 
 
 
270 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  48.66 
 
 
270 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  43.87 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  45.28 
 
 
272 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  39.85 
 
 
272 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  41.79 
 
 
273 aa  201  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  39.31 
 
 
269 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  38.87 
 
 
278 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  40.53 
 
 
269 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.46 
 
 
273 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  28.46 
 
 
273 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.46 
 
 
273 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 
273 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  29.58 
 
 
273 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.46 
 
 
273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
266 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  30.26 
 
 
266 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.49 
 
 
273 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  27.49 
 
 
273 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  27.49 
 
 
273 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  27.49 
 
 
273 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  27.49 
 
 
273 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 
266 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.63 
 
 
266 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  29.82 
 
 
271 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  30.6 
 
 
272 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30 
 
 
271 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  31.25 
 
 
270 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  30.83 
 
 
269 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  29.96 
 
 
269 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  29.82 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.95 
 
 
268 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  28.52 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  25.19 
 
 
268 aa  99  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.83 
 
 
262 aa  99  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  29.56 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  25.87 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  30.26 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.34 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.86 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.24 
 
 
279 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  26.81 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 
269 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  25.64 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  24.91 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0783  HAD superfamily hydrolase  25.18 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.84 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  25.87 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  25.37 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  29.1 
 
 
273 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  28.15 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  24.2 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.87 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.2 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.3 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  24.2 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  24.2 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  24.2 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  24.2 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.2 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.2 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  27.6 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.34 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  30.04 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  24.63 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  27.01 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  26.69 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.47 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  31.34 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  27.4 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  24.64 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  27.78 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  30.58 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.33 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.78 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  26.79 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  26.79 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.84 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  22.51 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  26.89 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.99 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  25.76 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.99 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  26.92 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  26.92 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  24.53 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>