More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6319 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  61.8 
 
 		 270 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  59.48 
 
 		 270 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  60.3 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  57.25 
 
 		 272 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  56.44 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  48.28 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  44.83 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  50.57 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  42.49 
 
 		 282 aa  228  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  47.89 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  47.51 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  47.51 
 
 		 267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  47.89 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  43.07 
 
 		 292 aa  215  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  45.72 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  42.15 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  41.89 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  41.44 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  40.54 
 
 		 269 aa  184  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  32.46 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  32.71 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  31.37 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  30.6 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  29.52 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  30.57 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  28.84 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.48 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  27.49 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  29.32 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  27.21 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.49 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  27.09 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.09 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.19 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  26.19 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  26.19 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  26.19 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  26.19 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  27.5 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  27.5 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.5 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.59 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.16 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  30.37 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  27.09 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  25.69 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2666  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.14 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.968723  normal  0.0125888 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  27.14 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1405  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4533  hypothetical protein  30.15 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30 
 
 		 271 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  25.53 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  26.34 
 
 		 272 aa  92  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  29.06 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  29.26 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25.56 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  29.26 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  29.26 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  29.26 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  31.48 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  25.1 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  27.38 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  24 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  26.26 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  28.62 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.78 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4607  hypothetical protein  29.78 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  28.62 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  28.62 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  28.15 
 
 		 281 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  24 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4408  putative conserved hypothetical protein  29.14 
 
 		 287 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  30.16 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  28.42 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  25.28 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  24.44 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  28.25 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  28.62 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.78 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  28.72 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  23.36 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  27.13 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  28.62 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  28.06 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  27.78 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.83 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>